G a b y ' s   B l o g

Pour continuer la série d'articles sur la bio-informatique : Les banques de séquences et de données biologiques.

Une des conséquences du séquençage du génome de l'espèce humaine et de nombreuses autres espèces (blé, maïs, drosophile, vers, bactéries et levures du boulanger) est l'accumulation de données d'origine biologique (séquençage et expériementations). Non seulement les séquences y figurent, mais aussi toutes les annotations, remarques, hypothèses et liens avec d'autres séquences (et expériences).

Classification par types de gènes ou par degré de similarité, les banques de données issues du séquençage et du recoupement des données sont réparties un peu partout dans le monde (et dépendent des centres de recherches d'où sont issues ces données). De nombreux outils de navigations et de notations y sont présents (une notation normalisée standard est utilisée entre certaines banques de données issues du séquençage, pour chaque fiche concernant un gène ou une protéine).

Quelques liens en plus... Exemples de banques de données biologiques

• EMBL Nucleotide Sequence Database
• GenBank
• DDBJ
• Swiss-Prot
• Ressources du Genoscope
• Banques de séquences, Infobiogen
• Banques de séquences biologiques à l'Institut Pasteur
• Exploration des banques de données biologiques
• Centre de bio-informatique et de biologie computationnelle de l'université de Laval