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G a b y ' s   B l o g

 18.03.2006   

Bio-Informatique

18 Mars 2006

Bioinformatics en anglais, c'est l'utilisation des techniques informatiques en biologie (analyse de séquences de façon automatique, simulation de processus) ; ou inversement, c'est aussi l'application des connaissances en biologie pour les systèmes informatiques ou l'analyses de données, comme les évènements sur les réseaux ou au sein d'un système informatique plus ou moins complexe (au moins aussi complexe qu'un organisme au sens biologique du terme)...

La bio-informatique est l'interface entre plusieurs techniques, notamment de biologie (biologie moléculaire, biologie cellulaire, biochimie, génomique, protéomique...), mais aussi des techniques classiques d'analyses de données de façon mathématiques (statistiques) et d'inforlatique (bases de données, programes et algorithmes...). L'utilisation conjointe de ces techniques permet l'analyse des données issues de la biologie (séquençage du génome), la simulation à une autre échelle (simulation de cellules, simulation de cultures de cellules ou modélisation de populations) et la modélisation de molécules pharmaceutiques (drug-design).

Ceci permet une analyse formelle des processus biologiques (implémentation et évaluation mathématiques impossibles à faire à la main). Plusieurs étapes majeures dans le travail en bio-informatique (analyse des données brutes en données qualifiables et quantifiables, analyse de ces données pour une mise en relation avec des données expérimentales). L'informatique permet une gestion plus globale et un recoupement des données (séquences et annotations pour les gènes et protéines, recherches expérimentales, hypothèses et découvertes).

La modélisation moléculaire ainsi que les simulations (cellules, processus biochimiques) et les modélisations de populations sont des applications de ces recoupements et font partie de la bio-informatique. Ces protocoles d'expérimentation (reposant essentiellement sur l'informatique) sont des applications directes des recherches développées aux paragraphes précédents et permettent de mieux comprendre les phénomènes biologiques : biochimie cellulaire, évolution des espèces (phylogénie)...

Articles prévus sur le sujet de la bio-informatique sur ce blog :
  1. Bases de la biologie
  2. Alignement de séquences
  3. Banques de séquences et de données
  4. Phylogénie
  5. Drug-design
  6. Séquençage
  7. Et quelques plus :
    • Algorithmes génétiques
    • Vie Artificielle
    • Partage de temps de Calcul
    • Intelligence Artificielle et systèmes experts...



@+
Gaby


Publié dans la catégorie : Biologie


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